I.目的
检定载体上是否接上了外来的DNA片段,常因质体不同而有不同的方法。基本上一般常见的检定方法有以下几种,第1种是外来DNA片段的插入导致载体某种表现型的丧失(insertional inactivation)作为筛选的依据。第2种是利用插入的DNA上带有宿主菌株不具有的表现型进行筛选。第3种若载体与插入DNA片段上皆无适当的筛选依据,则可将转形株中的质体抽出后,以限制酶切割再进行电泳分析。
本实验中所用的质体pT7-6并无简易快速筛选重组质体的方法可利用,利用lacZ基因表现b-gal尚须具T7 promoter之菌种,故无法以X-gal机制分解使菌落呈现蓝色。最后我们必须利用传统的方法,自菌落中抽取质体DNA再以洋菜胶做电泳分析。
II.重组DNA(recombinant DNA)之检定
1.仪器用具:
a. 桌上型离心机
b. 抽风柜
c. 37 °C恒温箱
d. 迷你电泳槽及铸胶器
e. UV transilluminator
f. 拍立得相机或数字元影像分析系统
2.药品与试剂:
a. 限制酶:HindIII及EcoRI
b. 10 x Restriction buffer B: 100 mM Tris-HCl, pH 8.0, 50 mM MgCl2, 1 M NaCl, 10 mM 2-mecaptoethanol
c. 其它参照实验1~4
3.方法步骤:
1)由实验6转形得到的正反应(positive)菌落,分别接种于Amp plate(当作template)及3 ml LB+Amp培养液中,标明编号,置于37 °C振荡培养过夜。
2)进行小量质体DNA之抽取(参照实验1)。
3)每一株各取3ml质体DNA以HindIII/EcoRI切割,另取pT7-6亦做限制酶切割以为对照(参照实验3)。
4)以1% agarose gel进行电泳分析(参照实验3),由电泳图谱中挑选带有lacZ基因片段即为重组质体。
注:电泳胶片在照相后不要丢弃,请保留继续进行Southern blotting。
Ⅲ.重组DNA快速检定法
1.此方法系以phenol/chloroform溶菌后直接进行电泳分析,并未将质体DNA与宿主染色体DNA分离,得到的DNA也不能用限制酶切割。但因其快速简便,所以可藉之于短时间内检定大量转形株中质体DNA的相对分子量,以初步筛选带有重组质体的转形株。
2.仪器用具:
同上
3.药品及试剂:
a. 1 x STE : 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 100 mM NaCl, 10 mM EDTA
b. phenol/chloroform/isoamyl alcohol (PCI)
c. RNase A
4.方法与步骤:
1)由实验6得到的转形株,以接种环将菌体刮下,分别接种于Amp plate(当作template)再悬浮大部分菌体于30 ml 1 x STE中,振荡混合均匀。(最好有pT7-6的菌体做相同的处理以为对照)
2)加入30 ml PCI,剧烈振荡。
3)12,000 rpm离心3分钟。
4)把上层水溶液相转移至另一干净的离心管,加入1 ml RNase A及3 ml 10x 追踪染剂,以50 V进行电泳分析。
5)以泳电率对应分子量大小,选取质体分子量大约于pT7-6者,即为重组质体。