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限制性内切酶酶切反应

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一、实验方案
1.反应一般在灭菌的0.5ml离心管中进行。
2.20μl体积反应体系如下: 
      DNA                      0.2-1  μg
      10×酶切buffer            2.0  μl
      限制性内切酶              1-2  u
      加ddH2O                   至  20 μl
限制性内切酶最后加入,轻轻混匀,稍加离心,放置于最适温度水浴并按所需的时间温育,一般为37℃水浴消化1h。
3.用于回收酶切片段时,反应总体积可达50-200μl,各反应组分需相应增加。
4.多种酶消化时若缓冲液条件相同,可同时加入;否则,先做低温或低盐的酶消化,再做高温或高盐的酶消化。
5.酶切结束时,加入0.5M EDTA(pH 8.0)使终浓度达10mM,以终止反应。或将反应管在65℃水浴放置10min以灭活限制性内切酶活性。
6.如消化反应体积过大,电泳时加样孔盛不下,可加以浓缩:终止反应后,加入0.6体积的5M 乙酸铵(或1/10体积3M NaAc)和2倍体积无水乙醇,在冰上放置5min,然后于4℃离心12000g,5min。倾去含大部分蛋白质的上清液。于室温晾干DNA沉淀后溶于适量TE中(pH 7.6)。
7.如要纯化消化后的DNA,可用等体积酚/氯仿(1∶1)和氯仿各抽提一次,再用乙醇沉淀。
二、电泳检测
取酶切产物适量,加1/2体积的loading buffer混匀上样,以未经酶切的质粒或/和酶切的空载体(如有)作对照,进行电泳。
三、注意事项
1. 选择适当的限制酶缓冲液,一般酶的说明书中会明确。
2. 购买的限制性内切酶多保存于50%甘油中,应尽量减少反应体积,但要确保酶体积不超过反应总体积的10%,否则酶活性将受到甘油的抑制。

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